免疫系统疾病都属于比较复杂的疾病，病因不明。强直性脊柱炎也是如此，根据大量的临床研究，目前认为可能与下列因素有一定关系：
1、遗传。本病发病与遗传因素有密切关系，强直性脊柱炎的HLA-B27阳性率高达90%～96%，家族遗传阳性率达23.7%。类风湿者其家族的发病率为正常人的2～10倍，而强直性脊柱炎家族的发病率为正常人的30倍。
2、病毒感染。近年来的研究发现本病的发生可能与感染有关。
(1) 与肠道感染有关：对强直性脊柱炎病人进行大便细菌培养，结果显示，肺炎克雷白杆菌阳性率达79%，而在正常人群中为30%，说明肺炎克雷白杆菌感染的频率明显高于正常人。另外还发现强直性脊柱炎患者血清肺炎克雷白杆菌抗体水平明显升高，阳性率为43.3%，而正常人阳性率为4.4%，说明强直性脊柱炎与肠道感染有关。近年来柳氮磺吡啶治疗强直性脊柱炎疗效较好，也进一步支持肠道感染与强直性脊柱炎有一定关系的论点。
(2) 与泌尿生殖系统感染有关：据资料统计，发现部分男性病人有前列腺炎、精囊炎，因此认为泌尿生殖系统感染是本病重要的诱发因素。感染通过淋巴系统从前列腺、精囊等途径扩散到骶髂关节、骨盆，然后再扩散进入体循环而引起系统性症状和周围关节、肌腱与滑膜等而引起病变。
(3) 结核感染和局疗感染等。
3、内分泌失调或代谢障碍：由于类风湿多见于女性，而强直性脊柱炎多见于男性，故被认为内分泌失调与本病有关。但利用激素治疗类风湿并未取得明显效果，激素失调与本症的关系也没有肯定。肾上腺皮质机能亢进的病人患类风湿或强直性脊柱炎的比率无明显增加或减少。
4、其他因素：年龄、体质、营养不良、气候、水土、潮湿和寒冷。其它包括外伤、甲状旁腺疾病、上呼吸道感染、局部化脓感染等，可能与本病有一定关系，但证据不足。
虽然强直性脊柱炎的发病原因还不是很清楚，但大家也不必因此恐慌，现在医学发展已经很先进了，患者如果身体不适，尽早去医院诊断，及早治疗，疗效还是很好的。
